桌面式凍干機和傳統的冷凍干燥系統相比是將冷阱和干燥室集成為一個整體，冷阱的作用是通過凝結盤管實現。真空泵的入口在凝結盤管處，為系統維持真空度，使物料中水分升華，再在凝結盤管上凝華。熱量是由受單片機控制系統的執行元件電加熱器提供。制冷的系統選取針對臺式凍干機所蓄負荷小和物料在加工過程中所需負荷不均勻的特點而定為自動復疊制冷系統。該自動復疊系統所采用的高溫制冷工質是溫度滑移小的設備。

　　自動復疊制冷系統的冷量調節是通過兩個級別的旁通閥實現的，旁通閥采用電子膨脹閥，其控制脈沖來源于單片機控制系統。在自動復疊制冷系統中，分別在高、低溫的制冷劑的回路上設置單向閥，這是為保證壓縮機可以正常開機。另一點和一般的自動復疊制冷系統不同的是采用回熱器，這種回熱器的設置除了可以加大低溫制冷劑的過冷度外，還可以作低溫制冷劑的緩沖容器用，避免低溫制冷劑蒸汽由于壓力異常回流到蒸發器。

　　桌面式凍干機注意事項：

　　1.凍干機必須使用獨立電源插座有良好接地。

　　2.凍干機須在環境溫度在5-30℃下工作，這樣有利于延長壓縮機壽命，壓機長期在30℃以上會造成壓縮機損壞。

　　3.制冷系統二次啟動，須在3分鐘之后，這樣有利于壓機壽命。

　　4.如果托盤及外掛凍干瓶同時使用，先放托盤物料，待半小時后制冷溫度為-50℃或-80℃、壓力為30mTorr時再外掛凍干瓶，以免使掛瓶物料融化。

　　5.物料必須凍實，預凍溫度建議在-30℃以下，凍干樣品非水溶解物（如有機溶解物）或者為80%以上高濃度的糖類等不易結凍的樣品，須在-80℃以下的預凍室內預凍，預凍時間不小于24小時，在48小時以上。

　　6.有機玻璃凍干倉取下時，必須輕放在橡膠等柔軟物體上，以免有機玻璃受損而漏真空。

　　7.所放物料的多少與環境溫度的高低有關，冷阱溫度在-55℃至-40℃或-85℃至-80℃及真空度在5-100mTorr均為正常。

　　8.空氣回填時，請將通入真空回填氣體壓力調至0.5Kg以下。

　　9.禁止陽光直射。

　　10.禁止將其他散熱設備放在凍干機附近，造成制冷系統無法散熱，致使儀器不能工作及壓縮機損壞。